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世博园区共有13个出入口，这些出入口配置了五百余个检票闸口，以迎接每天密集的参观客流。其中有8个地面常规出入口，有5个位于浦东（白莲泾出入口、高科西路出入口、上南路出入口、长清路出入口、后滩出入口），3个位于浦西（鲁班路出入口、西藏南路出入口、半淞园路出入口）。此外还有4个水上出入口，也称为“水门”，这四个园外水门中，其昌栈、秦皇岛路、十六铺水门仅限团客入场，东昌路水门以散客为主。乘客乘坐航班可进入园区内的水门码头。另外，园区内共设有M1、M2、M3三个水门码头，到达不同的片区。剩下的1个是轨道交通出入口，世博园区轨道交通专用线共有马当路、卢浦大桥站和世博大道站，在马当路站设有安检检票点，游客可凭世博门票检票后，免费乘坐到达世博园区。
世博园区内的公车、地铁和渡轮都是免费的，如果游客想从一个片区到另外一个片区，可以问园区内的志愿者，志愿者是随处可见的，有问题找他们是最好的选择。
